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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

相约“云端”，文博点亮创意之城******

　　作者：邓海建

　　12月28日，第十八届中国（深圳）国际文化产业博览交易会在深圳拉开序幕。作为国家级、国际化、综合性文化产业博览交易会，文博会为中国文化产业的高质量发展注入了强劲动力。本届文博会采用线下为主、线上同步的方式，设置6大展馆、一个线上国际馆和一个云上文博会平台。线上线下的双轨运作各放异彩，让文博会成为真正永不落幕的文化盛会。

　　创新奔涌、创意融合，这是一场“展”与“城”的对话。文博会每年汇聚海内外10多万种文化创意产业展品，4000多个文化产业投融资项目在现场进行展示与交易，为中国文化产业的高质量发展注入了强劲动力。这里，是中外文化产业探索展示的“首选地”、是全球文化消费体验的“主舞台”，更是兼具项目交易、投资促进、人文交流、合作互鉴的“超链接”。

　　潮流前沿的文博会早早开启了“云端相约”的版图。2020年，第十六届文博会在线上成功举办，文博会数字化元年就此开启；2021年，第十七届文博会首次实现了文博会线上线下双轨运作，真正意义上实现了“永不落幕的文博会”。今年，第十八届文博会则分为线下博览与交易、云上展示与交流和配套活动三大部分，将“线下博览与交易”与“云上展示与交流”有机结合，继续“双线”叙事。千里之远、万里之遥，借助全方位、多角度、全链条式的数智革新，人们在云开幕、云展厅、云招商、云签约、云大数据——“五朵云”展示交流的基础上，共同畅想文化新消费。

　　“中国文化产业第一展”常变常新，不变的，是文博会对城市文化创意产业的点亮与赋能。深圳将文化产业打造为四大支柱产业之一的目标，受益于文博会的平台支撑和撬动作用，城市文化产业发展迅猛。目前，深圳文化产业增加值已突破2500亿元，占全市GDP8%，法人单位数超过10万家，从业人员超过100万，总体发展水平处于全国前列，创意设计、动漫游戏、数字文化等行业在全国的竞争优势明显。

　　蓬勃的市场主体、优秀的创意人才、成熟的制度环境，让“展”与“城”既互相促进，更互相成就。值得一提的是，文博会的溢出效应越发彰显。比如，借助深圳文博会平台，福建德化的“富贵红”瓷器，签下6000万美元的订购大单，迈出了走向世界的一步；甘肃兰州歌舞剧院出品的《大梦敦煌》，漂洋过海走向世界，让中华优秀传统文化远播国外……在促进中华优秀传统文化创造性转化、创新性发展层面，文博会的支点作用更为凸显。

　　十八载风雨兼程，文博会大放异彩。相信今年的文博会，必会提振各方信心、凝聚各界共识，以馨暖的南方之风，带领中国文化创意产业真正走进2023年的“春天里”。（邓海建）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）